太平天国的内部崩溃是从杨秀清与洪秀全不和开始的，杨秀清往往借着上帝之口，来对洪秀全横加指责，以放大自己的威权，使得太平天国内部矛盾不断激化与升级，最终导致太平天国将领之间的分崩离析。

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关于洪秀全在宫内如何虐待宫女一事，杨秀清居然也一清二楚，可见杨秀清的眼线之广，触角之长，已经到了洪秀全几乎无法控制的地步，两人最终的分道扬镳，想来是必然的吧。杨秀清以上帝代言人的身份，借上帝之口指责洪秀全说：

洪秀全为了在宫中挖一口池塘，就忍心叫宫女们在雨雪中劳动;说洪秀全的那些妻妾，对在宫中做事的宫女们挑三拣四，任意嘲笑或辱骂，甚至不允许她们在宫中干活;洪秀全对宫女们提到维修宫殿或打扫花园之类的小事，不是训斥就是阻碍她们做事，或者无端地吓唬她们;还说洪秀全在生气时，拿脚去踢宫女或者用别的方式去惩罚宫女，甚至连身怀六甲的宫女也大骂。

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杨秀清代表上帝传达了这些指责，过了两天，他又在另外一个场合，再以太平天国高管忠王的身份，谈了自己对此事的看法，敦促洪秀全就虐待宫女一事做出回应。

在太平天国定都天京后，杨秀清已经由洪秀全的战友变成了新利益的瓜分者。

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他屡屡借着上帝代言人的角色，先是在洪秀全身上找毛病，继而对其他高层吹毛求疵，他总是通过这种宗教仪式，将太平天国的审判权，包括死刑审判权抓到了自己的手里。杨秀清在这种游戏中晕晕乎乎的，不知深浅，最后引来杀身之祸。